ДНК-проект: общие вопросы

[asan-kaygy]

У меня нормально заходит

[Samtat]

Сейчас нормально стало.

[ZOOTECHNICIAN]

Я могу зайти только через прокси-сервис.

Если у вас Яндекс, то у меня то-же самое. 

Лезьте через Google ( Chrome)

У Яндекса заморочки появились. 

[Samtat]

У них там были неполадки, теперь всё восстановилось.

[asan-kaygy]

Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature19792.html#affil-auth

[asan-kaygy]

http://www.colta.ru/news/12464

Научно-просветительский портал «Антропогенез.ру» и фонд «Эволюция» учредили премию, которая будет присуждаться за выдающиеся достижения в области лженауки.
Премия получила название «Почетный академик ВРАЛ».

Действительными членами ВРАЛ уже стали Трофим Денисович Лысенко (посмертно), Джуна (посмертно) и Амвросий Амбруазович Выбегалло (виртуально)».

Полный список полуфиналистов:

1. Гаряев Петр
2. Ермакова Ирина
3. Задорнов Михаил
4. Клесов Анатолий
5. Мулдашев Эрнест
6. Петрик Виктор
7. Прокопенко Игорь
8. Скляров Андрей
9. Фоменко Анатолий
10. Чудинов Валерий

[Samtat]

МолГен ломанули?

[кылышбай]

Е.В. Балановская, О.П. Балановский. Русский генофонд на Русской равнине

... «Русских генов» нет, как нет генов украинских, татарских или французских! «Привязать» ген к любому народу вообще невозможно по многим причинам.

ГЕНЫ. Во-первых, время и место возникновения гена скрыто в глубине времён. Ген (то есть его новый вариант - аллель, гаплотип) может «родиться» в одном месте, а случайно «размножиться» до заметных величин совсем в другом месте или даже в нескольких неродственных популяциях, куда его занесло случайными ветрами миграций. Например, нам доподлинно известно, что один из капитанов некогда привёз на свою родину - в Архангельск - полинезийскую принцессу. Кто знает, быть может волею судьбы через ряд поколений какой-то из прибывших с принцессой генов станет частым на Русском Севере? И Вам придётся называть его «русским» - ведь Вы не можете отличить его от остальных. От рождения гена до того, как он станет «знаменитым» (или хотя бы известным) проходит не только много времени, но и случается много непредвиденных событий. Но самое главное помнить: практически все гены родились тогда, когда нынешних народов ещё не было на свете.

ЛЮДИ. Во-вторых, не только гены, но и люди непредсказуемы. Они не только заключают браки на небесах, но и своих детей «записывают в народы» произвольно. Нам не менее доподлинно известна семья, которая в советские времена записала своих трёх сыновей: одного - русским, второго - армянином, третьего - евреем. Кому-нибудь в жизни да повезёт! В любом случае, потомки метисных браков если не сразу, то постепенно принимают чью-то одну сторону и считают себя русским или французом безотносительно к тому, сколько чьих генов они несут. Но ведь от того, кем мы себя считаем, наши гены не меняются - они остаются все теми же, безымянными - не русскими и не французскими, а просто генами.

ПОПУЛЯЦИИ. В-третьих, сами популяции не могут существовать, не обмениваясь генами друг с другом. Генетически «чистых» популяций не бывает (исключение одно - популяция вида, всё человечество). А если так, то какие же гены считать «русскими»? Ведь чем на большее число поколений мы спустимся в любую родословную, тем больше мы насчитаем «пришлых» генов. Более того, чем глубже мы будем погружаться в прошлое популяции, тем больше мы будем отходить от современного народа (русского, украинского, татарского или французского) и переходить к тем «пранародам», из которых он вырос. Например, погружаясь в генетическое прошлое русского народа, мы уже вскоре окажемся среди генофонда иного народа, который дал начало и русским, и украинцам, и белорусам. А ещё глубже - и среди ещё иного генофонда: народа, который дал начало русским, марийцам, удмуртам, коми... И среди ещё нескольких генофондов, частью влившихся в состав русского. Но при этом не заметим никаких качественных различий в наблюдаемом нами генофонде: одних генов стало чуть больше, других чуть меньше, но нигде нет той границы, где бы вдруг неизвестно откуда дружно появились на свет «русские» (или «украинские», или «татарские») гены. Нет их! И нет оттого, что народ и его генофонд не являются некой неизменной замкнутой единицей - напротив, это динамичный, живой, подверженный постоянным изменениям «суперорганизм», умеющий, как и все живые организмы, сохранять своё единство и перерастать в своих потомков.

 

 

[Samtat]

журнал «Медицинская генетика».Архивы

http://www.medgen-journal.ru/jour/issue/archive

[asan-kaygy]

Генетика династий
http://podcast.govoritmoskva.ru/?p=6820

[asan-kaygy]

http://ybrowse.org/gbrowse2/gff/snps_hg19.csv
Здесь набор SNP-мутаций из поисковика ybrowse.org, который ежедневно обновляется.

[Samtat]

Опубликовали(наконец-то ) материалы сборника ЗЦ-2016. Доступ бесплатный, но нужна регистрация:

http://elibrary.ru/contents.asp?issueid=1677807

[Alee]

А это что за тест ? В Америке ДНК-тесты так дешево стоят ?

 

[asan-kaygy]

сколько стоит по видео?

[Samtat]

Аутосомы? Парень сказал, что набор стоит 100$.

[asan-kaygy]

сейчас аутосомы еще дешевле стоят

[Musa]

19 часов назад, asan-kaygy сказал:

сейчас аутосомы еще дешевле стоят

 

Цитата

Y-хромосома передается как кусок ДНК от отца к сыну, в основном неизменно через поколения если бы не случайные мутации.

Эти случайные мутации, которые случаются естественно и обычно безопасны, называются маркерами. Как только маркеры идентифицированы, генетики могут возвращаться во времени и прослеживать их к точке, в которой они сначала произошли, определяя уникальное предковую линию.

Скажите пожалуйста, в связи с чем происходит мутация Y-хромосомы?

мутация Y-хромосомы происходит через каждое поколение, с учетом влияния Х-хромосомы от матери?

если мутация Y-хромосомы происходит не через каждое поколение, а когда как, то как можно установить предполагаемую дату этой мутации? 

[asan-kaygy]

2 часа назад, Musa сказал:

 

Скажите пожалуйста, в связи с чем происходит мутация Y-хромосомы?

мутация Y-хромосомы происходит через каждое поколение, с учетом влияния Х-хромосомы от матери?

если мутация Y-хромосомы происходит не через каждое поколение, а когда как, то как можно установить предполагаемую дату этой мутации? 

Мутации бывают разные.

СНП-мутации в У-хромосоме в среднем раз в 4 поколение встречаются, а СТР-мутации у отца и сына уже разные могут быть.

По всем этим СНП и СТР вполне можно средний возраст общего предка подсчитать, главное чтобы тестированных было много

[кылышбай]

в графиках многомерного шкалирования для определения расстояний между генофондами (например в посл. работе по аргынам) как входные данные используются все три источника генофонда: аутосомы, Y-хромосома и мТ-ДНК? что значит родство с иранцами, и в то же время с казахами Алтая? судя по такому разбегу там не только Y-гаплогруппа учитывалась

[zet]

А где почитать про это?

[asan-kaygy]

46 минут назад, кылышбай сказал:

в графиках многомерного шкалирования для определения расстояний между генофондами (например в посл. работе по аргынам) как входные данные используются все три источника генофонда: аутосомы, Y-хромосома и мТ-ДНК? что значит родство с иранцами, и в то же время с казахами Алтая? судя по такому разбегу там не только Y-гаплогруппа учитывалась

только У-гаплогруппа

[asan-kaygy]

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=15896

[Uighur]

Самтат,  недавно вы поясняли, что все r1a у тюрков имеют общие субсклады (я плаваю в генетике, если не вру - поправьте).

То есть r1a тюркского субсклада не одно и тоже что r1a, скажем, славянского?

Возникает вопрос, как коррелирует тюркская r1a с иранской r1a по субскладам?

Что это за общий предок такой был у нас с r1a ?

[кылышбай]

В БУДУЩЕМ РАСШИФРОВАТЬ ГЕНОМ МОЖНО БУДЕТ ВСЕГО ЗА 100 ДОЛЛАРОВ

[asan-kaygy]

И 1000 долларов интерпретация )))