Jump to content



Sign in to follow this  
asan-kaygy

ПалеоДНК : археологические культуры бронзового века

Recommended Posts

ПалеоДНК 101 человека из Евразии. В компании один из территории Казахстана.

По гаплогруппам картина следующая


  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites

Интересно: Алтай,Карасукская,Андроновская I1, I2, I2a? Ямная J2a?

Share this post


Link to post
Share on other sites

А ! Вроде разобрался, надо по цветовой гамме смотреть?

Share this post


Link to post
Share on other sites

Алтай : Q1a и J2a. Карасукская : Q1a и R1a. Андроновская :R1a. Синташтинская :R1a. Ямная:I2a и R1b.

Share this post


Link to post
Share on other sites

В этой таблице дана полная раскладка по гаплогруппам, археологическим культурам и могильникам по всем образцам из работы Allentoft et al. 2015

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1HuNPykGuq2PbHkUOL5dCiwrveIy-OGO2qOklwfsayW8/edit#gid=1004304005

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites

У  Алтайцев  очень высокий  R1b около 60%.

Share this post


Link to post
Share on other sites

У  Алтайцев  очень высокий  R1b около 60%.

Это ничего не означает.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Продолжу про Q1a из той же работы Allentoft et al 2015

RISE493   Sabinka 2   Karasuk 1500-1400 годы до н.э. (бронзовый век)
RISE600   Verh-Uimon  (железный век, нет точной датировки)
RISE601   Verh-Uimon  ((железный век, нет точной датировки)

 

http://forum.molgen.org/index.php/topic,3471.msg298722.html#msg298722

Share this post


Link to post
Share on other sites

Инфа с МолГена:

Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56(II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия)

А.С. Пилипенко1–3, В.И. Молодин2, 3, Р.О. Трапезов1, 2, С.В. Черданцев1, А.А. Журавлев1, 2
1Институт цитологии и генетики СО РАН пр. Академика Лаврентьева, 10, Новосибирск, 630090, Россия
2Институт археологии и этнографии СО РАН пр. Академика Лаврентьева, 17, Новосибирск, 630090, Россия
3Новосибирский государственный университет ул. Пирогова, 2, Новосибирск, 630090, Россия
В статье представлены результаты палеогенетического исследования останков двух индивидов (взрослого и ребенка), представляющих население Горного Алтая эпохи развитой бронзы, из погребального памятника Бертек-56 (плато Укок, Республика Алтай, Россия) и их интерпретация с учетом археологического и палеоантропологического контекста. Были исследованы четыре системы генетических маркеров: митохондриальная ДНК, полиморфный фрагмент гена амелогенина, аутосомные STR-локусы и STR-локусы Y-хромосомы. Для взрослого индивида получен полный объем данных по этим системам, а для ребенка – по структуре мтДНК, гену амелогенина и частичные профили аутосомных STR-локусов и STR-локусов Y-хромосомы. Генетические данные позволили определить мужской пол обоих погребенных. Установлено отсутствие прямого родства между индивидами. Филогенетический анализ показал принадлежность митохондриальной ДНК ребенка к западно-евразийской гаплогруппе K (подгруппа K1a24a), взрослого – к восточно-евразийской гаплогруппе C. С помощью программы-предиктора было установлено, что исследованный гаплотип Y-хромосомы мужчины (17 STR-локусов Y-хромосомы) относится к гаплогруппе Q, которая является характерной для популяций Восточной Евразии. Филогенетический и филогеографический анализ полученных палеогенетических данных свидетельствует в пользу происхождения исследуемой популяции Горного Алтая эпохи развитой бронзы в результате смешения двух генетически контрастных групп (с восточно-евразийскими и западно-евразийскими генетическими характеристиками), что согласуется с выводами археологов и антропологов об участии в формировании группы, оставившей памятник Бертек-56, как автохтонного населения региона, так и пришлой популяции из Западной Евразии.

http://archaeology.nsc.ru/journarticleru/68/1038

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
4 часа назад, Samtat сказал:

Инфа с МолГена:

Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56(II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия)

А.С. Пилипенко1–3, В.И. Молодин2, 3, Р.О. Трапезов1, 2, С.В. Черданцев1, А.А. Журавлев1, 2
1Институт цитологии и генетики СО РАН пр. Академика Лаврентьева, 10, Новосибирск, 630090, Россия
2Институт археологии и этнографии СО РАН пр. Академика Лаврентьева, 17, Новосибирск, 630090, Россия
3Новосибирский государственный университет ул. Пирогова, 2, Новосибирск, 630090, Россия
В статье представлены результаты палеогенетического исследования останков двух индивидов (взрослого и ребенка), представляющих население Горного Алтая эпохи развитой бронзы, из погребального памятника Бертек-56 (плато Укок, Республика Алтай, Россия) и их интерпретация с учетом археологического и палеоантропологического контекста. Были исследованы четыре системы генетических маркеров: митохондриальная ДНК, полиморфный фрагмент гена амелогенина, аутосомные STR-локусы и STR-локусы Y-хромосомы. Для взрослого индивида получен полный объем данных по этим системам, а для ребенка – по структуре мтДНК, гену амелогенина и частичные профили аутосомных STR-локусов и STR-локусов Y-хромосомы. Генетические данные позволили определить мужской пол обоих погребенных. Установлено отсутствие прямого родства между индивидами. Филогенетический анализ показал принадлежность митохондриальной ДНК ребенка к западно-евразийской гаплогруппе K (подгруппа K1a24a), взрослого – к восточно-евразийской гаплогруппе C. С помощью программы-предиктора было установлено, что исследованный гаплотип Y-хромосомы мужчины (17 STR-локусов Y-хромосомы) относится к гаплогруппе Q, которая является характерной для популяций Восточной Евразии. Филогенетический и филогеографический анализ полученных палеогенетических данных свидетельствует в пользу происхождения исследуемой популяции Горного Алтая эпохи развитой бронзы в результате смешения двух генетически контрастных групп (с восточно-евразийскими и западно-евразийскими генетическими характеристиками), что согласуется с выводами археологов и антропологов об участии в формировании группы, оставившей памятник Бертек-56, как автохтонного населения региона, так и пришлой популяции из Западной Евразии.

http://archaeology.nsc.ru/journarticleru/68/1038

Рахмет

Share this post


Link to post
Share on other sites
В 09.12.2016 в 20:44, Samtat сказал:

Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56(II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия)

http://elibrary.ru/item.asp?id=27389205

 В работе опубликован гаплотип, но не думаю, что   ради этого стоит покупать статью.

Share this post


Link to post
Share on other sites
В 10.12.2016 в 01:01, asan-kaygy сказал:

Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56(II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия)


Гаплотип:

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385a/b DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458
14 24 13 9 15-21 0 0 11 14 14 30 16
                       
DYS437 DYS448 YGATAH4 DYS456 DYS438 DYS635            
14 19 10 16 12 22            

Share this post


Link to post
Share on other sites

Рахмет

Share this post


Link to post
Share on other sites

Не уверен, что у всех есть доступ , но кому интересно-пробуйте... :)

 

Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия)

В статье представлены результаты палеогенетического исследования останков двух индивидов (взрослого и ребенка), представляющих население Горного Алтая эпохи развитой бронзы, из погребального памятника Бертек-56 (плато Укок,  Республика Алтай, Россия) и их интерпретация с учетом археологического и палеоантропологического контекста. Были исследованы четыре системы генетических маркеров: митохондриальная ДНК, полиморфный фрагмент гена амелогенина, аутосомные STR-локусы и STR-локусы Y-хромосомы. Для взрослого индивида получен полный объем данных по этим системам, а для ребенка – по структуре мтДНК, гену амелогенина и частичные профили аутосомных STR-локусов и STR-локусов Y-хромосомы. Генетические данные позволили определить мужской пол обоих погребенных. Установлено отсутствие прямого родства между индивидами. Филогенетический анализ показал принадлежность митохондриальной ДНК ребенка к западно-евразийской гаплогруппе K (подгруппа K1a24a), взрослого – к восточно-евразийской гаплогруппе C. С помощью программы-предиктора было установлено,  что исследованный гаплотип Y- хромосомы мужчины (17 STR-локусов Y-хромосомы) относится к гаплогруппе Q, которая является характерной для популяций Восточной Евразии. Филогенетический и филогеографический анализ полученных палеогенетических данных свидетельствует в пользу происхождения исследуемой популяции Горного Алтая эпохи развитой бронзы в результате смешения двух генетически контрастных групп (с восточно-евразийскими и западно-евразийскими генетическими характеристиками), что согласуется с выводами археологов и антропологов об участии в формировании группы, оставившей памятник Бертек-56, как автохтонного населения региона, так и пришлой популяции из Западной Евразии.

https://www.researchgate.net/publication/311562402_A_Genetic_Analysis_of_Human_Remains_from_the_Bronze_Age_2nd_Millennium_BC_Cemetery_Bertek-56_in_the_Altai_Mountains_in_Russian

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
В 12.12.2016 в 22:44, Samtat сказал:

Гаплотип:

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385a/b DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458
14 24 13 9 15-21 0 0 11 14 14 30 16
                       
DYS437 DYS448 YGATAH4 DYS456 DYS438 DYS635            
14 19 10 16 12 22  

Аналогичный гаплотип The haplotype distributions of Mongolian ethnic minority in Liaoning Province, China :

 

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385 DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458
14 23 13 9 15,21 0 0 11 14 14 30 16

 

DYS437 DYS448 YGATAH4 DYS456 DYS438 DYS635
14 19 10 15 12 22

Share this post


Link to post
Share on other sites
11 часов назад, Samtat сказал:

Интересные результаты. :)

По результатам предикции и снипирования:

rsultats2.png

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
15 часов назад, Samtat сказал:

Статья с МолГена:

https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01296484/document

 

Интересные результаты. :) Есть гаплотипы.

Эта та самая диссертация про палеоДНК )))

Рахмет

Share this post


Link to post
Share on other sites
3 часа назад, Samtat сказал:

По результатам предикции и снипирования:

rsultats2.png

Предиктор Урасина?

Share this post


Link to post
Share on other sites
3 часа назад, asan-kaygy сказал:

Предиктор Урасина?

Похоже, что Антея. Ссылка дана на него:

http://www.hprg.com/hapest5/

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites

Результаты по Монгольскому Алтаю(сагсайцы) были известны ещё в 14 году.

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites

)))

Share this post


Link to post
Share on other sites
4 часа назад, Samtat сказал:

Результаты по Монгольскому Алтаю(сагсайцы) были известны ещё в 14 году.

Плюс в том, что на этот раз опубликовали гаплотипы. По R1a есть смысл сравнить с казахскими Кете, с кыргызами, балкарами и т.д. R1b напоминают европейские. 

Хотя есть ли смысл сравнивать на 17 маркерах (или10-ти) без глубоких снипов ? Может кому интересно будет.  По Q, по -моему, из наиболее близких эвенские гаплотипы.

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
28 минут назад, Samtat сказал:

Плюс в том, что на этот раз опубликовали гаплотипы. По R1a есть смысл сравнить с казахскими Кете, с кыргызами, балкарами и т.д. R1b напоминают европейские. 

Хотя есть ли смысл сравнивать на 17 маркерах (или10-ти) без глубоких снипов ? Может кому интересно будет.  По Q, по -моему, из наиболее близких эвенские гаплотипы.

А из r1b какие самые близкие ? 

Share this post


Link to post
Share on other sites

Одновременно вышла другая статья:

http://science.sciencemag.org/content/early/2018/05/08/science.aar7711

The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia

    Peter de Barros Damgaard1,*, Rui Martiniano2,3,*, Jack Kamm2,*, J. Víctor Moreno-Mayar1,*, Guus Kroonen4,5, Michaël Peyrot5, Gojko Barjamovic6, Simon Rasmussen7, Claus Zacho1, Nurbol Baimukhanov8, Victor Zaibert9, Victor Merz10, Arjun Biddanda11, Ilja Merz10, Valeriy Loman12, Valeriy Evdokimov12, Emma Usmanova12, Brian Hemphill13, Andaine Seguin-Orlando1, Fulya Eylem Yediay14, Inam Ullah1,15, Karl-Göran Sjögren16, Katrine Højholt Iversen7, Jeremy Choin1, Constanza de la Fuente1, Melissa Ilardo1, Hannes Schroeder1, Vyacheslav Moiseyev17, Andrey Gromov17, Andrei Polyakov18, Sachihiro Omura19, Süleyman Yücel Senyurt20, Habib Ahmad15,21, Catriona McKenzie22, Ashot Margaryan1, Abdul Hameed23, Abdul Samad24, Nazish Gul15, Muhammad Hassan Khokhar25, O. I. Goriunova26,27, Vladimir I. Bazaliiskii27, John Novembre10,28, Andrzej W. Weber29, Ludovic Orlando1,30, Morten E. Allentoft1, Rasmus Nielsen31, Kristian Kristiansen16, Martin Sikora1, Alan K. Outram22, Richard Durbin2,3,†, Eske Willerslev1,2,32,†

Abstract

The Yamnaya expansions from the western steppe into Europe and Asia during the Early Bronze Age (~3000 BCE) are believed to have brought with them Indo-European languages and possibly horse husbandry. We analyze 74 ancient whole-genome sequences from across Inner Asia and Anatolia and show that the Botai people associated with the earliest horse husbandry derived from a hunter-gatherer population deeply diverged from the Yamnaya. Our results also suggest distinct migrations bringing West Eurasian ancestry into South Asia before and after but not at the time of Yamnaya culture. We find no evidence of steppe ancestry in Bronze Age Anatolia from when Indo-European languages are attested there. Thus, in contrast to Europe, Early Bronze Age Yamnaya-related migrations had limited direct genetic impact in Asia.

Считается, что ямная экспансия из Западной степи в Европу и Азию в раннем бронзовом веке(~3000 лет до н. э.) принесла с собой индоевропейские языки и, возможно, коневодство. Мы анализируем 74 древние последовательности целого генома со всей Внутренней Азии и Анатолии и показываем, что Ботайцы, связанные с самым ранним коневодством, происходят из популяции охотников-собирателей, разошедшейся глубоко в древности с предками представителей ямной культуры. Наши результаты также свидетельствуют о различных миграциях, приносящих западноевропейский генетический компонент в Южную Азию до и после, но не во времена Ямной культуры. Мы не находим никаких свидетельств степного генетического компонента в Анатолии бронзового века, когда там засвидетельствованы Индоевропейские языки. Таким образом, в отличие от Европы, Ямная миграция раннего бронзового века имела ограниченный прямой генетический эффект в Азии.

 

В статье есть результаты анализа ботайцев:

Population	SampleID	ObservedSN	Representat	Lineage
Botai_CA	BOT15	N-M231	N-M231	N
Botai_CA	BOT14	R-M478	R-M478	R1b1a1
Kurma_EBA	DA354	Q-M1083	Q-L472	Q1a
Lokomotiv_EN	DA357	C-F4015	C-F4015	C2b1a1
Lokomotiv_EN	DA359	N-M2087.1	N-M2087.1	N1c
Okunevo_EMBA	RISE673	Q-M1100	Q-L472	Q1a
Okunevo_EMBA	RISE683	Q-L712	Q-L712	Q1a1b1
Okunevo_EMBA	RISE672	Q-M346	Q-M346	Q1a2
Okunevo_EMBA	RISE674	Q-M346	Q-M346	Q1a2
Okunevo_EMBA	RISE662	Q-L54	Q-L54	Q1a2a1
Okunevo_EMBA	RISE664	Q-L330	Q-L330	Q1a2a1c
Okunevo_EMBA	RISE718	Q-L330	Q-L330	Q1a2a1c
Okunevo_EMBA	RISE719	Q-L334	Q-L330	Q1a2a1c
Okunevo_EMBA	RISE670	Q-L940	Q-L940	Q1a2b
Okunevo_EMBA	RISE675	R-Z2105	R-Z2015	R1b1a2a2
Shamanka_EBA	DA334	Q-L55	Q-L53	Q1a2a
Shamanka_EBA	DA335	Q-L53	Q-L53	Q1a2a
Shamanka_EBA	DA336	Q-L53	Q-L53	Q1a2a
Shamanka_EBA	DA337	Q-L475	Q-L53	Q1a2a
Shamanka_EBA	DA338	Q-L53	Q-L53	Q1a2a
Shamanka_EBA	DA339	Q-L334	Q-L330	Q1a2a1c
Shamanka_EN	DA247	N-M231	N-M231	N
Shamanka_EN	DA251	N-M2291	N-M2291	N1
Shamanka_EN	DA245	N-L666	N-L666	N1c2
Shamanka_EN	DA248	N-L666	N-L666	N1c2
Shamanka_EN	DA362	N-L666	N-L666	N1c2
Shamanka_EN	DA250	NO-M214	NO-M214	NO1
UstIda_EBA	DA361	Q-M346	Q-M346	Q1a2
UstIda_EBA	DA353	Q-L476	Q-L53	Q1a2a
UstIda_EBA	DA356	Q-L213	Q-L53	Q1a2a
UstIda_EBA	DA343	Q-L54	Q-L54	Q1a2a1
UstIda_LN	DA345	N-M2080	N-M46	N1c1
UstIda_LN	DA355	Q-L892	Q-M346	Q1a2
Yamnaya	YamnayaKaragash_EMBA	R-CTS1843	R-CTS1843	R1b1a2a2c1
Turkmenistan_IA	DA382	R-F992	R-F992	R1a1a1b2
Namazga_CA	DA379	J-L134	J-M304	J
Namazga_CA	DA381	J-L26	J-L26	J2a1
Anatolia_EBA	MA2212	J-L559	J-M410	J2a
Anatolia_MLBA	MA2200	J-L26	J-L26	J2a1
Anatolia_MLBA	MA2205	J-L27	J-L26	J2a1
Anatolia_MLBA	MA2208	G-M3317	G-M406	G2a2b1

 

  • Одобряю 3

Share this post


Link to post
Share on other sites

Create an account or sign in to comment

You need to be a member in order to leave a comment

Create an account

Sign up for a new account in our community. It's easy!

Register a new account

Sign in

Already have an account? Sign in here.

Sign In Now
Sign in to follow this  

×
×
  • Create New...