Перейти к содержанию
asan-kaygy

Казахский ДНК-проект

Рекомендуемые сообщения

http://sc.edu.gov.kz/ru/about/organization/institut-molekulyarnoi-biologii-i-biohimii-im-ma-aithozhina
8. Молекулярно-генетическая характеристика казахов Южно-Казахстанской, Жамбылской и Алматинской областей на основе однонуклеотидной и микросателлитной вариабельности Y-хромосомы
Задачи проекта:

Изучить вариабельность Y-хромосомы казахов Южно-Казахстанской, Жамбылской и Алматинской областей с использованием современных молекулярно-генетических подходов для получения экспериментальных данных о происхождении казахов.

Период реализации проекта: 2015-2017 гг.

Текущий статус проекта: выполняется 

Контактная информация: 

Руководитель проекта: Айтхожина  Н.А.

моб. телефон: +7(777) 215-33-08

email: aytkhozhina@mail.ru

Общая сумма финансирования проекта: 9 950 000 тенге

Освоено: 8 960 000 тенге

Источник финансирования: республиканский бюджет

Достигнутые результаты проекта: 

Коллекция ДНК дополнена 369 образцами, общее количество образцов в коллекции – 809 образцов;
Путем анализа 31 однонуклеотидных полиморфизмов, а также с помощью предикторов  определены 29 гаплогрупп Y-хромосомы. Определены гаплотипы по панели 25 микросателлитных локусов Y-хромосомы для 420 образцов (всего 678 образцов);
Построены медианные сети гаплотипов для линий и определен возраст наименее древнего общего предка кластеров; Выявлено, что распределение большинства гаплогрупп существенно варьирует в зависимости от родоплеменной принадлежности. Для большинства изученных родов был выражен эффект основателя. Анализ методом оценки молекулярных вариантов (AMOVA) показал, что разделение на жузы является условным, искусственным.

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

http://sc.edu.gov.kz/ru/about/organization/institut-obshchei-genetiki-i-tsitologii
1. Анализ генетической связи между потомками прото-казахской популяции аргын и древними костными останками гуннского периода из Венгрии
Цель проекта:

Определить возможное генетическое родство между потомками прото-казахской популяции аргын и костными останками гуннского периода из Венгерского музея естественной истории, представляющими косвенные свидетельства связи между нашими народами.

Основная идея Проекта заключается в использовании информативных ДНК-маркеров для определения возможного генетического родства между современными потомками древнего казахского племени – аргын и доступного археологического материала гуннского периода из Венгрии. Такое сравнительно-ретроспективное исследование в сочетании с литературными данными может помочь в решении некоторых вопросов этногеномики и реконструкции древних миграционных путей номадских племен на территории Центральной Азии и Европы.

Задачи проекта:

Анализ имеющихся в мировых и отечественных базах данных ДНК-профилей  казахов рода аргын.
Проведение ДНК-анализа современных потомков казахской протопопуляции аргын на основе использования биоматериалов, имеющихся в собственных генбанках, представляющих современное население Казахстана.
Организация экспедиций и сбор нового биоматериала, представляющего потомков мужского пола казахской протопопуляции аргын.
Выделение и генотипирование ДНК, определение гаплотипов Y-хромосомы в общей популяции современных аргын;
Детальный антропологический анализ костных останков гуннского периода, хранящихся в Венгерском музее естественной истории.
Забор образцов костной ткани для молекулярно-генетического исследования. Выделение ДНК из древних костных останков, оценка качества, генотипирование по микросателлитным локусам Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и аутосомным маркерам;
Пополнение базы данных Казахстанского ДНК-проекта и проекта «Казахстан» коммерческой компании Family Tree DNA (FTDNA, USA) ДНК-профилями современных казахов.
Анализ генетического родства между потомками протоказахской популяции аргын и костными останками гуннского периода из Венгерского музея естественной истории и попытка реконструкции миграционной истории древних кочевых племен.
Период реализации проекта: 2015-2017 гг.

Текущий статус проекта: выполняется 

Контактная информация: 

Руководитель проекта: Джансугурова Л.Б

раб.телефон: +7 (727) 269-45-87

моб. телефон: +7 (702) 257-25-71

email: leylad@mail.ru

Общая сумма финансирования проекта: 13 880 000 тенге

Освоено: 9 254 000 тенге

Источник финансирования: республиканский бюджет

Достигнутые результаты проекта: 

Проведен сбор нового биоматериала, представляющего современных казахов рода аргын (35 чел.). Выделены ДНК и осуществлено генотипирование по 17 локусам Y-хромосомы.

Определение гаплотипов показало, что в изученной когорте аргын представлено 14 гаплотипов Y-хромосомы. Это свидетельствует о разнообразии отцовских линий этого казахского рода.

Из костных останков гуннского периода выделена и охарактеризована палео-ДНК по количественным и качественным характеристикам. Проведено генотипирование палео-ДНК по 17 локусам Y-хромосомы, установлен L гаплотип Y-хромосомы.

Методами секвенирования проведен анализ мтДНК, установлен D4j12 гаплотип. Проведена реконструкция облика древнего объекта.

Филогенетический анализ показал азиатское генетическое происхождение гуннского объекта из Венгрии, что подтверждает миграционную историю гуннов.

Проблемы выявленные в рамках проекта:

Ннедостаточный объем финансирования проекта приводит к нехватке финансовых средств для приобретения дорогостоящих реактивов.

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

4 часа назад, asan-kaygy сказал:

1. Анализ генетической связи между потомками прото-казахской популяции аргын и древними костными останками гуннского периода из Венгрии
2. Определение гаплотипов показало, что в изученной когорте аргын представлено 14 гаплотипов Y-хромосомы. Это свидетельствует о разнообразии отцовских линий этого казахского рода

 

4 часа назад, asan-kaygy сказал:

 3. Молекулярно-генетическая характеристика казахов Южно-Казахстанской, Жамбылской и Алматинской областей на основе однонуклеотидной и микросателлитной вариабельности Y-хромосомы. Коллекция ДНК дополнена 369 образцами, общее количество образцов в коллекции – 809 образцов

вы в этих проектах задействованы и есть вообще какой нибудь обмен данными и мнениями между этими проектами и вашей работой, проектом ДНК-Шежире и т.д.?

1. на основании каких тезисов финансируется этот проект из бюджета? на связи "мажаров, мадьяров и гаплогруппе G"?

2. вы согласны с этим? теоретически любая популяция в определенных временных промежутках имеет разнообразные отцовские линии. но как раз таки в привычнах временных рамках аргыны ярко демонстрируют эффект основателя. даже есть серьезная работа по этому - уникальная в мире в этой области - вы недавно ее тут публиковали ссылку на нее

3. 369 из этого проекта, а остальные из 809 из шежире и Казахского ДНК проекта ФТДНА? есть ли смысл дублировать те проекты этой работой? и опять же за счет бюджета. да и результаты вполне ожидаемы. когда работа будет доступна?

 

я лично конечно рад что именно в этом направлении есть финансирование и увеличивается база данных казахского генофонда. но я считаю, что часть этих средств лучше было б потратить на full-Y  некоторых "казахских" гаплогрупп, у которых не все дерево расшифровано. а также (это не менее важно) родственных гаплотипов среди других этносов для выявления  возраста общего предка, истории этногенеза и миграции

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

17 часов назад, кылышбай сказал:

вы в этих проектах задействованы и есть вообще какой нибудь обмен данными и мнениями между этими проектами и вашей работой, проектом ДНК-Шежире и т.д.?

1. на основании каких тезисов финансируется этот проект из бюджета? на связи "мажаров, мадьяров и гаплогруппе G"?

2. вы согласны с этим? теоретически любая популяция в определенных временных промежутках имеет разнообразные отцовские линии. но как раз таки в привычнах временных рамках аргыны ярко демонстрируют эффект основателя. даже есть серьезная работа по этому - уникальная в мире в этой области - вы недавно ее тут публиковали ссылку на нее

3. 369 из этого проекта, а остальные из 809 из шежире и Казахского ДНК проекта ФТДНА? есть ли смысл дублировать те проекты этой работой? и опять же за счет бюджета. да и результаты вполне ожидаемы. когда работа будет доступна?

я лично конечно рад что именно в этом направлении есть финансирование и увеличивается база данных казахского генофонда. но я считаю, что часть этих средств лучше было б потратить на full-Y  некоторых "казахских" гаплогрупп, у которых не все дерево расшифровано. а также (это не менее важно) родственных гаплотипов среди других этносов для выявления  возраста общего предка, истории этногенеза и миграции

Нет не задействован.

1. Типа. Тут наши великолепные генетики, которые этот проект написали, вообще хуже интернет-юзеров разбираются в вопросе

2. Не согласен

3. Не знаю когда будет доступна работа, но то гос задание на которое выделили 882 млн. тенге на исследование казахов провалено. Ни статьи ни книги и столько денег ушло

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

Второй проект гораздо лучше по Старшему жузу. Там и денег меньше потратили и результаты хоть как то выходили

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

Ошибки первого проекта можно легко объяснить. сделаю это либо в статье либо в очерке

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

нда, все было б смешно если б не так грустно от таких вещей в стране. а ведь еще постеснялся написать "на основе Аргын=ар+Гун") 

сколько сейчас стоит full Y? на FTDNA рождественские распродажи и Y-111 стоит 319$

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

 Аsan-kaygy , с Вашего разрешения процитирую:

2. Казахи 

2.1. Кыпчаки (Узун, Колденен, Карабалык) относятся к субкладу R1b1a1-M73 [28].

2.2. Бултын-Кыпчаки (Мадьяр, Кулатай и др.) относятся к гаплогруппе J2-M172 [26].

2.3. Аргыны относятся к гаплогруппе G1 [41]

2.4. Конырат (Кунгират) относят к субкладу С2b-M407 [29]

2.5. Алшыны относятся к субкладу С2а-М48 [26]

2.6. Уйсуны относятся двум субкладам: подразделения Шакшам, Сары-Уйсун, Дулат, Албан, Суан, Шапрашты относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер), подразделение Сргелы относится к субкладу N1c1-F4205 [31] [26].

2.7. Найманы. У Найманов доминирует 3 субклада: Баганалы найманы относятся к субкладу R1b1a2-Z2103, Толегетай найманы (Каракерей, Тортуыл, Матай, Садыр) относятся к субкладу О3- М175, Сарыжомарт найманы относятся к субкладу С2а-М48 [54] [26].

2.8. Табыны. У Косеули (Тартулы) Табынов доминирует субклад R1a-Z2124, у Шомишты и Таракты Табынов доминирует гаплогруппа С2-М217 [32]

2.9. Кереи относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер) [33] [39]

2.10. Шанышкылы (Катаган) относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер) [26], который есть у Уйсунов и Кереев. Старкластер традиционно отождествляется с монгольскими нирунами (нирунскими родами).

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

35 минут назад, Samtat сказал:

 Аsan-kaygy , с Вашего разрешения процитирую:

Уйсуны относятся двум субкладам: подразделения Шакшам, Сары-Уйсун, Дулат, Албан, Суан, Шапрашты относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер), подразделение Сргелы относится к субкладу N1c1-F4205 [31] [26].

я не asan-kaygy, но с его и вашего разрешению вставлю свои 5 копеек:

1. смотря как интерпретировать многочисленные варианты Шежире Сыргели можно не относить к уйсынам, а перечислить как отдельный род. я кстати предлагал это когда еще не были известны результаты анализов и не знал про этот форум вообще. как мы видим Сыргели оказались действительно не родственны с остальными уйсынами (или кырме или не уйсыны или генетические туристы)

2. род Уак из Среднего жуза относится к N1c-F4205 и со слов asan-kaygy у них с Сыргели общий предок жили не ранее 8-10 веков

3. все казахские старкластеры F4002 можно по общим мутациям разделить на несколько гаплотипов (при этом две группы кереев окажутся далеки друг от друга: одна близка к уйсынам - четко коррелируется с Шежире)

 

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

56 minutes ago, Samtat said:

 Аsan-kaygy , с Вашего разрешения процитирую:

2. Казахи 

2.1. Кыпчаки (Узун, Колденен, Карабалык) относятся к субкладу R1b1a1-M73 [28].

2.2. Бултын-Кыпчаки (Мадьяр, Кулатай и др.) относятся к гаплогруппе J2-M172 [26].

2.3. Аргыны относятся к гаплогруппе G1 [41]

2.4. Конырат (Кунгират) относят к субкладу С2b-M407 [29]

2.5. Алшыны относятся к субкладу С2а-М48 [26]

2.6. Уйсуны относятся двум субкладам: подразделения Шакшам, Сары-Уйсун, Дулат, Албан, Суан, Шапрашты относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер), подразделение Сргелы относится к субкладу N1c1-F4205 [31] [26].

2.7. Найманы. У Найманов доминирует 3 субклада: Баганалы найманы относятся к субкладу R1b1a2-Z2103, Толегетай найманы (Каракерей, Тортуыл, Матай, Садыр) относятся к субкладу О3- М175, Сарыжомарт найманы относятся к субкладу С2а-М48 [54] [26].

2.8. Табыны. У Косеули (Тартулы) Табынов доминирует субклад R1a-Z2124, у Шомишты и Таракты Табынов доминирует гаплогруппа С2-М217 [32]

2.9. Кереи относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер) [33] [39]

2.10. Шанышкылы (Катаган) относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер) [26], который есть у Уйсунов и Кереев. Старкластер традиционно отождествляется с монгольскими нирунами (нирунскими родами).

У торе,меркит,жалайыров какая гаплогруппа?

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

23 часа назад, кылышбай сказал:

нда, все было б смешно если б не так грустно от таких вещей в стране. а ведь еще постеснялся написать "на основе Аргын=ар+Гун") 

сколько сейчас стоит full Y? на FTDNA рождественские распродажи и Y-111 стоит 319$

Big Y можно заказать за 425 долларов

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

1 час назад, Samtat сказал:

 Аsan-kaygy , с Вашего разрешения процитирую:

2. Казахи 

2.1. Кыпчаки (Узун, Колденен, Карабалык) относятся к субкладу R1b1a1-M73 [28].

2.2. Бултын-Кыпчаки (Мадьяр, Кулатай и др.) относятся к гаплогруппе J2-M172 [26].

2.3. Аргыны относятся к гаплогруппе G1 [41]

2.4. Конырат (Кунгират) относят к субкладу С2b-M407 [29]

2.5. Алшыны относятся к субкладу С2а-М48 [26]

2.6. Уйсуны относятся двум субкладам: подразделения Шакшам, Сары-Уйсун, Дулат, Албан, Суан, Шапрашты относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер), подразделение Сргелы относится к субкладу N1c1-F4205 [31] [26].

2.7. Найманы. У Найманов доминирует 3 субклада: Баганалы найманы относятся к субкладу R1b1a2-Z2103, Толегетай найманы (Каракерей, Тортуыл, Матай, Садыр) относятся к субкладу О3- М175, Сарыжомарт найманы относятся к субкладу С2а-М48 [54] [26].

2.8. Табыны. У Косеули (Тартулы) Табынов доминирует субклад R1a-Z2124, у Шомишты и Таракты Табынов доминирует гаплогруппа С2-М217 [32]

2.9. Кереи относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер) [33] [39]

2.10. Шанышкылы (Катаган) относятся к субкладу C2a-F4002 (старкластер) [26], который есть у Уйсунов и Кереев. Старкластер традиционно отождествляется с монгольскими нирунами (нирунскими родами).

Рахмет

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

38 минут назад, кылышбай сказал:

я не asan-kaygy, но с его и вашего разрешению вставлю свои 5 копеек:

1. смотря как интерпретировать многочисленные варианты Шежире Сыргели можно не относить к уйсынам, а перечислить как отдельный род. я кстати предлагал это когда еще не были известны результаты анализов и не знал про этот форум вообще. как мы видим Сыргели оказались действительно не родственны с остальными уйсынами (или кырме или не уйсыны или генетические туристы)

2. род Уак из Среднего жуза относится к N1c-F4205 и со слов asan-kaygy у них с Сыргели общий предок жили не ранее 8-10 веков

3. все казахские старкластеры F4002 можно по общим мутациям разделить на несколько гаплотипов (при этом две группы кереев окажутся далеки друг от друга: одна близка к уйсынам - четко коррелируется с Шежире)

 

2. предок жили около 950 лет назад плюс минус погрешность

3. у двух групп кереев отличие в одном стр маркере, без Биг У трудно измерить возраст
 

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

18 минут назад, Peacemaker сказал:

У торе,меркит,жалайыров какая гаплогруппа?

их мало, поэтому в статье не было. а меркитов у казахов есть мелкий подрод но связан он с теми меркитами не понятно

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

asan-kaygy, кит 171594 (tilik 14-th century, bugal, Kadyrzhan 20c., kazak) я так понял из рода Ысты. у протестированных ысты не наблюдается мажорность F4002? если б не старкластер у большинства шапырашты - можно было б выдвинуть тезис о родстве шапырашты, ысты, ошакты с сыргели (как в одной из версии Шежире)?

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

1 час назад, zet сказал:

А с кеми же еще?

Это может быть имя из шежире

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

8 минут назад, кылышбай сказал:

asan-kaygy, кит 171594 (tilik 14-th century, bugal, Kadyrzhan 20c., kazak) я так понял из рода Ысты. у протестированных ысты не наблюдается мажорность F4002? если б не старкластер у большинства шапырашты - можно было б выдвинуть тезис о родстве шапырашты, ысты, ошакты с сыргели (как в одной из версии Шежире)?

У Ысты доминирует J1

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

5 часов назад, asan-kaygy сказал:

У Ысты доминирует J1

 

Откуда они у них взялись непонятно? Кунаев ведь тоже ысты, но у него вроде С2?

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

Вопрос ув. Асан-Кайгу:

Надоело мне неучу-ДНК знанию все эти странные и незнакомые буквы с цифрами.:wub:

Скажите более грубее или более прямо. Казахи это монголы в большинстве или тюрки в большинстве? Как я понимаю цель ваших исследований именно это.

Ссылка на комментарий
Поделиться на другие сайты

Для публикации сообщений создайте учётную запись или авторизуйтесь

Вы должны быть пользователем, чтобы оставить комментарий

Создать аккаунт

Зарегистрируйте новый аккаунт в нашем сообществе. Это очень просто!

Регистрация нового пользователя

Войти

Уже есть аккаунт? Войти в систему.

Войти


×
×
  • Создать...