• 0
аскер

ДНК-проект: общие вопросы

Question

http://vivovoco.nns.ru/VV/JOURNAL/VRAN/03_...7/ETHNOGENE.HTM

Из рис.4 видно, что в целом европеоидные линии встречаются у всех без исключения тюрков и в целом доминируют над монголоидными. Мне кажется это достаточный факт для того, чтобы признать, что европеидность тюркам была присуща изначально и вовсе не является молодым субстратом.

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites

Recommended Posts

  • 0
4 часа назад, asan-kaygy сказал:

Его тезис бред, язык и У-хромосома не имеют 100 % корреляции и даже 80 % не имеют

правда долгая изоляция и природные условия позволили в нек. регионах обособиться: уральским языкам и гаплогурппе N, языкам на-дене и гаплогруппе C. хотя и тут примеры не такие "чистые"

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
22 часа назад, asan-kaygy сказал:

Его тезис бред, язык и У-хромосома не имеют 100 % корреляции и даже 80 % не имеют

Это с позиции сегодняшнего дня, речь про прототюркскИЕ языкИ. Впрочем, в рукопожатной среде все это конечно бред)

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
20 часов назад, Туран сказал:

Это с позиции сегодняшнего дня, речь про прототюркскИЕ языкИ. Впрочем, в рукопожатной среде все это конечно бред)

А вы считаете что язык передается по У-хромосоме?

По моему нет. Для всех очевидно что язык это социальное а У-хромосома малая часть биологического и это из разных плоскостей

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
Появилась генетическая компания для тестирования собак. Цены пока немного дороже тестирования людей.
Как назвали это на форуме «Собачий 23эндМи :) Вплоть до функционала».
  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

в чем различие между возрастом кластера, рассчитанным с использованием генеологической скорости мутации и с использованием эволюционной скорости мутации?

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
17 минут назад, кылышбай сказал:

в чем различие между возрастом кластера, рассчитанным с использованием генеологической скорости мутации и с использованием эволюционной скорости мутации?

первую используют если точно известно что все тестируемые из одного субклада, а вторая если считаем общий возраст гаплогруппы

Если считать генеалогическими скоростями общую гаплогруппу то получаются фантомные возраста как часто было у Клесова

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=30939

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

Перепост

Цитата

Авраам - J1-YSC0000234, ВВ=ВБОП~5600 лет назад
Иаков (легендарный прародитель евреев) - J1-Y3081, ВВ~5600 лет назад, ВБОП ~5400 лет назад
Исмаил (легендарный прародитель арабов-аднанитов) - J1-Z1884, ВВ~5600 лет назад, ВБОП ~4600 лет назад
Аарон (легендарный прародитель коэнов, брат Моисея) -  J1-Y3088, ВВ ~5400 лет назад, ВБОП ~2900 лет назад
Али (легендарный прародитель сеидов) - J1-Y12361, ВВ=ВБОП~1450 лет назад

 

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
3 часа назад, asan-kaygy сказал:

Перепост

 

Перепост

Цитата

 

к узлу YSC0000234 сходятся предковые линии субклада L859 с высокой концентрацией курайшитов и Y3088 с высокой концентрацией коэнов. Но тогда в потомки генетического Исмаила попадают также евреи и европейцы, а в потомки генетического Исаака - арабы и европейцы.

1) Выявлено, что большинство сеидов относится к  J1-Y12361, ВБОП~1450 лет назад, что согласуется с исторической хронологией
2) Выявлено, что большинство коэнов относится к    J1-Y3088, ВБОП ~2900 лет назад, что согласуется с исторической хронологией
3) Поскольку предковым для J1-Y12361 и J1-Y3088 узлом для арабского и еврейского духовных сословий является J1-YSC0000234, то выдвинуто предположение о соотнесении этого снипа с Авраамом, учитывая что его ВБОП составляет 5600 лет, что согласуется с периодом становления Ура Халдейского - родины ветхозаветного Авраама
4) Узлы J1-Y3081 и J1-Z1884 выбраны в качестве "иакобического" и "исмаилического" исключительно филогенгетически, как две нисходящие от Авраама точки коалесценции арабо-сеидских и еврейско-коэнских линий.
Все ВБОП формально вписываются в документальную хронологию авраамических религий.

 

 

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

получается, сеиды и коэны восходят к общим предкам, которые в свою очередь имеют одного праотца (Авраама)? 

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

Да

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
21 час назад, asan-kaygy сказал:

Перепост

 

среди потомков генетических Исмаила и Иакова есть и араба и евреи и там и там. значит предковыми были не именно эти мутации а мутации, появившиеся чуть позже них. а L859 и Y3088 чисто арабские и еврейские соответственно и появились после переселения аднанидов в Аравию

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

 

Цитата

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.23789

The genetic legacy of the Yaghnobis: A witness of an ancient Eurasian ancestry in the historically reshuffled central Asian gene pool

Elisabetta Cilli, Stefania Sarno, Guido Alberto Gnecchi Ruscone, Patrizia Serventi, Sara De Fanti, Paolo Delaini, Paolo Ognibene, Gian Pietro Basello, Gloria Ravegnini, Sabrina Angelini, Gianmarco Ferri, Davide Gentilini, Anna Maria Di Blasio, Susi Pelotti, Davide Pettener, Marco Sazzini, Antonio Panaino, Donata Luiselli, Giorgio Gruppioni

First published: 29 January 2019
https://doi.org/10.1002/ajpa.23789

Abstract

Objectives

The Yaghnobis are an ethno‐linguistic minority historically settled along the Yaghnob River in the Upper‐Zarafshan Valley in Tajikistan. They speak a language of Old Sogdian origin, which is the only present‐day witness of the Lingua Franca used along the Silk Road in Late Antiquity. The aim of this study was to reconstruct the genetic history of this community in order to shed light on its isolation and genetic ancestry within the Euro‐Asiatic context.
Materials and Methods

A total of 100 DNA samples were collected in the Yaghnob and Matcha Valleys during several expeditions and their mitochondrial, Y‐chromosome and autosomal genome‐wide variation were compared with that from a large set of modern and ancient Euro‐Asiatic samples.

Results

Findings from uniparental markers highlighted the long‐term isolation of the Yaghnobis. Mitochondrial DNA ancestry traced an ancient link with Middle Eastern populations, whereas Y‐chromosome legacy showed more tight relationships with Central Asians. Admixture, outgroup‐f3, and D‐statistics computed on autosomal variation corroborated Y‐chromosome evidence, pointing respectively to low Anatolian Neolithic and high Steppe ancestry proportions in Yaghnobis, and to their closer affinity with Tajiks than to Iranians.

Discussion

Although the Yaghnobis do not show evident signs of recent admixture, they could be considered a modern proxy for the source of gene flow for many Central Asian and Middle Eastern groups. Accordingly, they seem to retain a peculiar genomic ancestry probably ascribable to an ancient gene pool originally wide spread across a vast area and subsequently reshuffled by distinct demographic events occurred in Middle East and Central Asia.

 

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

Introducing Big Y-700 & Big Y Block Tree


Dear Group Project Administrators,

We are excited to announce the introduction of Big Y-700, a substantial upgrade to our Big Y-500 product. Along with the addition of 200 STRs, we have made significant updates across the board, including the new Big Y matching tool that was introduced last week.

A Big Y-700 white paper will be available with further details in a few weeks. Testers with Big Y-500 results pending will instead receive Big Y-700 results at no additional charge. These users will be emailed the expected delivery dates that are listed below in the FAQs section. This email will go out later this morning, Jan 30th, to all testers with pending results.

If you have further questions about Big Y-700 or specific kits, please contact the Group Project Administrator Team at groups@ftdna.com.
 

Big Y-700 at a glance
  • Expanded NGS targeting of genealogically useful Y-chromosome regions 
  • Revamped NGS chemistry that provides more uniform coverage within a much broader and targeted region of the Y
  • More consistent coverage improves comparison between any two results and allows more of the identified SNPs to be placed on the tree 
  • Increased number of STR markers provides more data points on paternal lineages and can help identify family-specific variants
 

Big Y Block Tree Matching Tool

In case you missed our announcement last week, we again wanted to introduce the new visualization tool for your Big Y matches called the Block Tree. This tool makes it easier to understand how the paternal lineages of you and your matches relate to each other. To read more about the new Big Y Block Tree, visit the Learning Center
 
mailservice?url=https%3A%2F%2Fgallery.ma
 
 
FAQs

How much will Big Y-700 cost?

mailservice?url=https%3A%2F%2Fgallery.mailchimp.com%2F390d5a162ff8d6f1abfee7834%2Fimages%2Fccdc53ca-b8fb-47da-bd63-c0af52c94868.png&proxy=yes&key=0072446a2b9ea6a5654ede7a5c88893b

Who gets the automatic upgrade to Big Y-700? 
  • All customers who placed Big Y-500 orders on or after Nov 1st, 2018 
  • All customers who placed Big Y-500 orders prior to Nov 1st, 2018 and have not yet received results

When will my results be ready?

mailservice?url=https%3A%2F%2Fgallery.mailchimp.com%2F390d5a162ff8d6f1abfee7834%2Fimages%2F9abc0758-4814-43a6-aae1-75e28bcfdea9.png&proxy=yes&key=25547d71b50aa1edc6be18a1dfd9e4e5

Come March, we expect Big Y lab processing time to be further streamlined, significantly reducing the turn around time for results to 2-4 weeks.


Will all kits that have a Big Y-500 test receive the automatic upgrade to Big Y-700?   
No. The additional information provided in Big Y-700 comes from updates and improvements in the overall design of the test itself, not just from improved variant calling and user interface, therefore, tests will need to be rerun using the new chemistry. For this reason, any kits that already have Big Y-500 results will not receive the automatic upgrade to Big Y-700.


How do I upgrade from a Big Y-500 to Big Y-700?
If you have already received Big Y-500 results, we expect to have an upgrade available to purchase by mid-March. We will notify Big Y-500 customers via email when the upgrade is available to purchase.

Keep in mind, when upgrading your kit, you must have a sample stored with us that can be tested or have the ability to send us another sample for testing.


If I already have Big Y-500 results, once I receive my new Big Y-700 results, can the results of the two tests be “merged” to eliminate a region’s no-call results if the other test has reads in that region?
Due to the extreme uniformity of the new Big Y-700 chemistry, we do not anticipate this being an issue.  


Are some of the currently reported STR values above 111 expected to change? 
It is possible that the improved test process will provide different STR values.


Who has access to the new Big Y Block Tree Matching Tool? 
Anyone with a Big Y test, regardless of version.


Will there be a tool for Group Project Administrators to compare the STRs?
We are currently exploring Big Y-500 and Big Y-700 results report tools for Group Project Administrators and will work to implement the best options as quickly as possible. 

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

Каждый раз чего-нибудь новенькое придумывают. Ещё вчера только прикидывал их маркетинговую политику, которая начиналась с 12-ти маркеров. Потом 25, 37 , 67. Дальше 67 не объективно, надо 111 маркеров. Затем стр маркеры это ерунда, нужно снип заказывать. Одного снипа мало, необходимо снип-пак. Потом БигУ. И так далее... :)

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
6 часов назад, Samtat сказал:

Каждый раз чего-нибудь новенькое придумывают. Ещё вчера только прикидывал их маркетинговую политику, которая начиналась с 12-ти маркеров. Потом 25, 37 , 67. Дальше 67 не объективно, надо 111 маркеров. Затем стр маркеры это ерунда, нужно снип заказывать. Одного снипа мало, необходимо снип-пак. Потом БигУ. И так далее... :)

Тоже замечаете.

Это ведь классическая пирамида. Ничего личного, только бизнес. Условность и амплитуды критериев и параметров одного уровня ведут к безусловной необходимости исследований другого уровня.

Как то так

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
14 часов назад, Samtat сказал:

Каждый раз чего-нибудь новенькое придумывают. Ещё вчера только прикидывал их маркетинговую политику, которая начиналась с 12-ти маркеров. Потом 25, 37 , 67. Дальше 67 не объективно, надо 111 маркеров. Затем стр маркеры это ерунда, нужно снип заказывать. Одного снипа мало, необходимо снип-пак. Потом БигУ. И так далее... :)

Лучше бы снизили цену на Биг У

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

Так и до телегонии дойдут. :) 

  • Одобряю 1

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
Цитата

The horse Y chromosome as an informative marker for tracing sire lines

https://www.nature.com/articles/s41598-019-42640-w

Sabine Felkel, Claus Vogl, Doris Rigler, Viktoria Dobretsberger, Bhanu P. Chowdhary, Ottmar Distl, Ruedi Fries, Vidhya Jagannathan, Jan E. Janečka, Tosso Leeb, Gabriella Lindgren, Molly McCue, Julia Metzger, Markus Neuditschko, Thomas Rattei, Terje Raudsepp, Stefan Rieder, Carl-Johan Rubin, Robert Schaefer, Christian Schlötterer, Georg Thaller, Jens Tetens, Brandon Velie, Gottfried Brem & Barbara Wallner

Abstract

Analysis of the Y chromosome is the best-established way to reconstruct paternal family history in humans. Here, we applied fine-scaled Y-chromosomal haplotyping in horses with biallelic markers and demonstrate the potential of our approach to address the ancestry of sire lines. We de novo assembled a draft reference of the male-specific region of the Y chromosome from Illumina short reads and then screened 5.8 million basepairs for variants in 130 specimens from intensively selected and rural breeds and nine Przewalski’s horses. Among domestic horses we confirmed the predominance of a young’crown haplogroup’ in Central European and North American breeds. Within the crown, we distinguished 58 haplotypes based on 211 variants, forming three major haplogroups. In addition to two previously characterised haplogroups, one observed in Arabian/Coldblooded and the other in Turkoman/Thoroughbred horses, we uncovered a third haplogroup containing Iberian lines and a North African Barb Horse. In a genealogical showcase, we distinguished the patrilines of the three English Thoroughbred founder stallions and resolved a historic controversy over the parentage of the horse ‘Galopin’, born in 1872. We observed two nearly instantaneous radiations in the history of Central and Northern European Y-chromosomal lineages that both occurred after domestication 5,500 years ago.

 

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0

походу первыми кроманьонцами Европы которые столкнулись с неандертальцами были люди из Y-гаплогруппы С1a и С1b.  Довольно не мало таких палеобразцов . 

из английского вики:

"Y-ДНК гаплогруппы C-V20 также была обнаружена у небольшого числа современных европейцев, [6] алжирских берберов, [7] армян, [8] и непальцев [9]. Он включает в себя множество образцов Y-ДНК, связанных с самой старой из известных в настоящее время популяцией анатомически современных людей в Европе (кроманьонцы), и считается носителем культуры верхнего палеолита ориньяк, возникшей 40 000 лет назад [10]."

 

 

Share this post


Link to post
Share on other sites
  • 0
4 часа назад, Мадьяр сказал:

походу первыми кроманьонцами Европы которые столкнулись с неандертальцами были люди из Y-гаплогруппы С1a и С1b.  Довольно не мало таких палеобразцов . 

из английского вики:

"Y-ДНК гаплогруппы C-V20 также была обнаружена у небольшого числа современных европейцев, [6] алжирских берберов, [7] армян, [8] и непальцев [9]. Он включает в себя множество образцов Y-ДНК, связанных с самой старой из известных в настоящее время популяцией анатомически современных людей в Европе (кроманьонцы), и считается носителем культуры верхнего палеолита ориньяк, возникшей 40 000 лет назад [10]."

неудивительно. С очень древняя в сравнении с др. гаплами

Share this post


Link to post
Share on other sites

Create an account or sign in to comment

You need to be a member in order to leave a comment

Create an account

Sign up for a new account in our community. It's easy!

Register a new account

Sign in

Already have an account? Sign in here.

Sign In Now